Các nhà khoa học tại Viện Nghiên cứu Y khoa Garvan và Viện Kirby thuộc Đại học New South Wales (UNSW) của Úc, đã đi tiên phong trong việc áp dụng một phương pháp giải trình tự gene mới đối với virus SARS-CoV-2 gây bệnh viêm đường hô hấp cấp COVID-19 có thể xác định đường lây lan của virus trong 4 giờ, thay vì từ 24 đến 48 giờ của phương pháp tiêu chuẩn.
Virus SARS-CoV-2 (màu xanh) trên bề mặt các tế bào lấy từ mẫu bệnh phẩm của một bệnh nhân nhiễm COVID-19. Ảnh minh họa: AFP
Phương pháp giải trình tự gene siêu nhanh này đã được các nhà khoa học tại 2 viện trên áp dụng tại bang New South Wales và sẽ được triển khai trên toàn Úc trong thời gian tới.
Phương pháp trên, được gọi là giải trình tự nanopore, giúp các cơ quan y tế nhanh chóng theo dõi các trường hợp nhiễm SARS-CoV-2 có mối liên hệ với nhau như thế nào, kích hoạt biện pháp cách ly kịp thời những người tiếp xúc gần và giảm thiểu rủi ro khác.
Ira Deveson, người đứng đầu nhóm công nghệ gene tại Trung tâm gen lâm sàng Kinghorn thuộc Garvan cho biết, bằng cách sử dụng các thiết bị nanopore, nhóm có thể tạo ra trình tự bộ gene cuối cùng nhanh nhất là trong vòng 2 giờ sau khi nhận được DNA được khuếch đại của virus SARS-CoV-2 từ một ca mắc bệnh. Thiết bị giải trình tự nanopore có kích thước bằng một chiếc điện thoại di động. Các sợi DNA được đưa qua các cảm biến nhỏ để đo dòng điện. Tín hiệu kết quả được giải mã để cung cấp trình tự DNA hoặc RNA cụ thể.
Tiến sĩ Deveson đánh giá đây là phương pháp có giá thành hợp lý, cơ động và không yêu cầu cơ sở hạ tầng phòng thí nghiệm cần thiết như các công cụ gene mầm bệnh tiêu chuẩn hiện nay.
Đã có những lo ngại về độ chính xác của phương pháp giải trình tự nanopore, nhưng các nhà khoa học của Viện Garvan và Kirby đã công bố một bài báo phân tích rõ về cách thức giải trình tự bộ gene virus SARS-CoV-2.
Được đăng trên tạp chí Nature Communications, bài báo không chỉ chứng minh độ chính xác cao của phương pháp giải trình tự siêu nhanh này mà còn cung cấp các hướng dẫn thực hành tốt nhất để các bệnh viện và phòng thí nghiệm khác của Úc và trên thế giới có thể áp dụng rộng rãi.
